Hoạt động Nghiên cứu và Phát triển (R&D) tại VJU đang được triển khai với sự hợp tác chặt chẽ với các đối tác như các trường đại học Nhật Bản, các trường đại học Việt Nam trong và ngoài hệ thống Đại học Quốc gia. gia đình. VJU cũng đang phát triển mạng lưới hợp tác với các doanh nghiệp R&D tại Việt Nam, Nhật Bản và các nước khác để phát triển và triển khai các dự án nghiên cứu chung hoặc dự án đặt hàng.

Trong năm 2017 và 2018, thông qua dự án đầu tư của Đại học Quốc gia Hà Nội, Chính phủ Việt Nam đã đầu tư các phòng thí nghiệm phục vụ giảng dạy, thực hành và nghiên cứu cho 03 Chương trình Thạc sĩ tại VJU (Công nghệ). Nano, Kỹ thuật môi trường và Kỹ thuật cơ sở hạ tầng). Các phòng thí nghiệm này đã đi vào hoạt động từ đầu năm 2018, hỗ trợ đắc lực cho hoạt động nghiên cứu và công tác giảng dạy, nghiên cứu của sinh viên.

Bên cạnh đó, với sự hỗ trợ của Chính phủ Việt Nam và các trường đại học phối hợp của Nhật Bản, một số trang thiết bị khác đã được đầu tư bổ sung như Thiết bị tính toán hiệu năng cao, Kính hiển vi điện tử quét, hệ thống máy tính phân tích và dự báo biến đổi khí hậu.

Tận dụng sự hỗ trợ từ Chính phủ Việt Nam và Nhật Bản, cũng như khả năng xây dựng đề cương nghiên cứu của đội ngũ giảng viên VJU, số lượng đề tài nghiên cứu do VJU tổ chức ngày càng tăng qua mỗi năm. Số lượng bài báo/ấn phẩm được xuất bản cũng tăng lên.